Kvalitet vode ima važan utjecaj na akvakulturu. Stoga je posebno važno da akvakultura bude upoznata s indikatorima detekcije, da provodi redovne inspekcije kvalitete vode i da pravovremeno reagira na prilagođavanje indikatora kvalitete vode.
Glavne stavke za testiranje voda za akvakulturu uključuju pH, amonijak dušik, rastvoreni kisik, nitrite, sulfide i salinitet. Među njima, rastvoreni kisik i odgovarajući pH su neophodni uslovi, dok su amonijak dušik, nitritni dušik i sulfid glavne otrovne tvari koje proizvodi metabolizam riba i škampa. Precizno i pravovremeno mjerenje koncentracije ovih tvari, a zatim poduzimanje odgovarajućih mjera, može značajno poboljšati stopu preživljavanja riba i škampa i smanjiti troškove uzgoja.